Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms