Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS01

TRGV10, T-cell receptor gamma variable 10 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRGV10A0A0A0MS01 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRGV10A0A0A0MS01 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRGV10A0A0A0MS01 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TRGV10A0A0A0MS01 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRGV10A0A0A0MS01 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRGV10A0A0A0MS01 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRGV10A0A0A0MS01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
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