Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H5

TRBV20OR9-2, T-cell receptor beta variable 20/OR9-2 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRBV20OR9-2A0A075B6H5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms