Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-213ENST00000494740 2273 ntTSL 516.49■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-203ENST00000462560 2553 ntTSL 1 (best)15.53■□□□□ 0.086e-7■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-201ENST00000360806 2080 ntBASIC14.86□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 PI4KAP2-210ENST00000480319 3872 ntTSL 210.16□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 PGD-208ENST00000493288 476 ntTSL 312.32□□□□□ -0.443e-6■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 FDFT1-217ENST00000530337 741 ntTSL 318.69■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.742e-6■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 CREG1-202ENST00000466652 794 ntTSL 39.11□□□□□ -0.959e-7■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 UBE2E3-212ENST00000602888 499 ntTSL 28.99□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 UBE2E3-210ENST00000602762 340 ntTSL 38.34□□□□□ -1.073e-6■■■■■ 28.4
UTP3Q9NQZ2 PUM1-211ENST00000498419 3068 ntTSL 57.31□□□□□ -1.243e-6■■■■■ 28.3
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 218.86■□□□□ 0.616e-19■■■■■ 28.3
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-217ENST00000573692 459 ntTSL 318.73■□□□□ 0.596e-19■■■■■ 28.3
UTP3Q9NQZ2 SRRM2-202ENST00000570539 431 ntTSL 210.88□□□□□ -0.676e-19■■■■■ 28.3
UTP3Q9NQZ2 USP48-209ENST00000487880 524 ntTSL 39.9□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 28.3
UTP3Q9NQZ2 OGT-211ENST00000498566 601 ntTSL 36.18□□□□□ -1.427e-7■■■■■ 28.3
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 28.3
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 28.3
UTP3Q9NQZ2 HSP90B1-203ENST00000548462 3032 ntTSL 212.86□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 28.3
UTP3Q9NQZ2 SREK1-213ENST00000523655 606 ntTSL 58.67□□□□□ -1.029e-7■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 TFRC-204ENST00000421258 524 ntTSL 313.53□□□□□ -0.242e-6■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 TFRC-208ENST00000464011 546 ntTSL 411.03□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 ENO1-205ENST00000492343 826 ntTSL 1 (best)8.67□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.323e-7■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC11-208ENST00000470626 883 ntTSL 320.37■□□□□ 0.856e-8■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 GOLGA3-206ENST00000541013 498 ntTSL 316.95■□□□□ 0.36e-8■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 ZCCHC11-202ENST00000355809 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.526e-8■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 GTPBP2-209ENST00000480263 898 ntTSL 215.09■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.586e-7■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 MAP2K2-208ENST00000599345 923 ntTSL 521.88■■□□□ 1.096e-7■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.956e-7■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 MXD1-205ENST00000465446 490 ntTSL 28.44□□□□□ -1.063e-6■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 AUP1-203ENST00000462297 457 ntTSL 310.7□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 28.2
UTP3Q9NQZ2 RPS19BP1-202ENST00000420879 861 ntTSL 220.3■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 CTSD-209ENST00000637158 1200 ntTSL 519.29■□□□□ 0.685e-12■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 CTSD-214ENST00000637937 1262 ntTSL 518.09■□□□□ 0.495e-12■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 AC068580.4-204ENST00000427721 1007 ntTSL 217.13■□□□□ 0.335e-12■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 AC068580.4-202ENST00000636579 350 ntTSL 316.08■□□□□ 0.165e-12■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 RPS19BP1-205ENST00000488602 2801 ntTSL 214.71□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-207ENST00000588542 1297 ntTSL 321.64■■□□□ 1.051e-6■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-210ENST00000589675 829 ntTSL 311.74□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 DDX39A-203ENST00000454233 922 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 28.1
UTP3Q9NQZ2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.652e-6■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-204ENST00000395136 1408 ntTSL 1 (best)27.8■■■□□ 2.042e-9■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 EDEM1-206ENST00000465369 1956 ntTSL 525.47■■□□□ 1.676e-7■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-212ENST00000475204 760 ntTSL 524.4■■□□□ 1.52e-9■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.192e-9■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 EDEM1-202ENST00000434243 978 ntTSL 214.18□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 LRBA-202ENST00000502839 814 ntTSL 312.44□□□□□ -0.422e-9■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-218ENST00000521438 2810 ntTSL 211.22□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.042e-9■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 IPO5-207ENST00000468620 480 ntTSL 26.46□□□□□ -1.386e-7■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 IPO5-223ENST00000491555 3688 ntTSL 26.34□□□□□ -1.46e-7■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 BRD8-225ENST00000515014 726 ntTSL 56.14□□□□□ -1.436e-7■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 CPED1-209ENST00000520801 553 ntTSL 411.99□□□□□ -0.493e-6■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 CPED1-204ENST00000428526 2219 ntTSL 28.11□□□□□ -1.113e-6■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 419.96■□□□□ 0.793e-7■■■■■ 28
UTP3Q9NQZ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.948e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 TBX1-205ENST00000484336 529 ntTSL 329.37■■■□□ 2.298e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 RNF114-205ENST00000623732 569 ntTSL 526.02■■□□□ 1.768e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 RNF114-208ENST00000625177 580 ntTSL 325.27■■□□□ 1.648e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.248e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 RNF114-203ENST00000622999 2438 ntTSL 222.71■■□□□ 1.238e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 RNF114-204ENST00000623528 624 ntTSL 321.45■■□□□ 1.028e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-204ENST00000433170 560 ntTSL 421.33■■□□□ 1.018e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-218ENST00000474936 695 ntTSL 221.33■■□□□ 1.018e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-226ENST00000488963 517 ntTSL 321.33■■□□□ 1.018e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EEF1A1-205ENST00000455918 701 ntTSL 220.89■□□□□ 0.938e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.98e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 RNF114-206ENST00000624620 565 ntTSL 220.65■□□□□ 0.98e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.818e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 CD81-206ENST00000481386 898 ntTSL 219.71■□□□□ 0.751e-9■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-202ENST00000420814 884 ntTSL 319.59■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-224ENST00000486316 406 ntTSL 419.59■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-227ENST00000490095 1001 ntTSL 519.59■□□□□ 0.738e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-230ENST00000495761 569 ntTSL 319.09■□□□□ 0.658e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.558e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-219ENST00000478224 507 ntTSL 318.27■□□□□ 0.528e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-206ENST00000449729 678 ntTSL 217.6■□□□□ 0.418e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-217ENST00000474618 566 ntTSL 316.93■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-221ENST00000482427 556 ntTSL 416.93■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-222ENST00000483333 674 ntTSL 516.93■□□□□ 0.38e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-203ENST00000430423 753 ntTSL 216.74■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-208ENST00000452882 598 ntTSL 316.74■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-231ENST00000498314 649 ntTSL 416.74■□□□□ 0.278e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.048e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-223ENST00000484999 728 ntTSL 515.03■□□□□ -08e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-214ENST00000582076 719 ntTSL 314.95□□□□□ -0.021e-9■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 AL117329.1-203ENST00000438810 585 ntTSL 313.99□□□□□ -0.172e-12■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-213ENST00000466850 546 ntTSL 213.31□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-215ENST00000470296 457 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.318e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.488e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-211ENST00000580676 1023 ntTSL 511.96□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 ARIH2-210ENST00000463204 522 ntTSL 511.26□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SPAG5-215ENST00000582175 657 ntTSL 511.21□□□□□ -0.611e-9■■■■■ 27.9
UTP3Q9NQZ2 SLC30A5-205ENST00000507354 2310 ntTSL 1 (best)10.64□□□□□ -0.718e-7■■■■■ 27.9
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 3446.6 ms