Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
VAX2Q9UIW0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VAX2Q9UIW0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms