Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KLHL13Q9P2N7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KLHL13Q9P2N7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms