Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PAK1IP1Q9NWT1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PAK1IP1Q9NWT1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms