Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMC4Q9NTJ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMC4Q9NTJ3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms