Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG7

SDR39U1, Epimerase family protein SDR39U1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR39U1Q9NRG7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SDR39U1Q9NRG7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SDR39U1Q9NRG7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms