Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 PRIMPOL-201ENST00000314970 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.097e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.17e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.17e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CTDSP1-210ENST00000491064 786 ntTSL 314.41□□□□□ -0.17e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRPV6-202ENST00000431833 247 ntTSL 314.38□□□□□ -0.117e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ERI2-208ENST00000564349 3657 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.117e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.117e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PML-207ENST00000435786 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.137e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.137e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 C15orf38-AP3S2-202ENST00000558648 664 ntTSL 514.24□□□□□ -0.137e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMUG1-217ENST00000509864 621 ntTSL 314.19□□□□□ -0.147e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.148e-7■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TNFAIP2-208ENST00000560670 1334 ntTSL 214.12□□□□□ -0.157e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.157e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 OXNAD1-204ENST00000452581 960 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.167e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LRRFIP1-209ENST00000473815 476 ntTSL 314.06□□□□□ -0.167e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MRPS27-204ENST00000508863 956 ntTSL 314.03□□□□□ -0.167e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GRIN1-211ENST00000471122 4184 ntTSL 1 (best)13.97□□□□□ -0.177e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 COTL1-202ENST00000561707 781 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.187e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NLGN3-202ENST00000374051 3913 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.187e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 POU6F2-209ENST00000524147 1485 ntTSL 513.9□□□□□ -0.187e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MRPS27-213ENST00000522404 550 ntTSL 413.88□□□□□ -0.197e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RYR1-202ENST00000359596 15117 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.197e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC006059.1-202ENST00000445452 473 ntTSL 513.84□□□□□ -0.197e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC006059.1-201ENST00000438017 722 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.197e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PHACTR1-209ENST00000482982 699 ntTSL 313.82□□□□□ -0.27e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GNB3-204ENST00000539127 590 ntTSL 313.77□□□□□ -0.217e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMAD7-204ENST00000586093 574 ntTSL 213.72□□□□□ -0.217e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AP3S2-201ENST00000336418 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.227e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 NLGN3-205ENST00000536169 3863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.227e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANO10-214ENST00000456438 545 ntTSL 413.66□□□□□ -0.227e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.237e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.237e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 INPP5J-208ENST00000412277 3512 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.237e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 FPGS-211ENST00000475270 560 ntTSL 213.59□□□□□ -0.237e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TXNDC16-201ENST00000281741 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.247e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IQSEC3-204ENST00000540907 398 ntTSL 213.45□□□□□ -0.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 METTL22-218ENST00000572956 706 ntTSL 313.44□□□□□ -0.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 METTL22-214ENST00000565866 561 ntTSL 313.44□□□□□ -0.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SPCS2-209ENST00000610881 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.268e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GGH-205ENST00000520609 1109 ntTSL 213.4□□□□□ -0.267e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MICAL3-218ENST00000584751 436 ntTSL 213.37□□□□□ -0.277e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SERPINF1-211ENST00000576406 795 ntTSL 313.36□□□□□ -0.278e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 MSN-206ENST00000609672 568 ntTSL 413.35□□□□□ -0.277e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF8-201ENST00000621650 9128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.277e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RYR1-201ENST00000355481 15377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.287e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AC073585.1-201ENST00000368895 1328 ntBASIC13.27□□□□□ -0.297e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP2-AS1-210ENST00000532353 576 ntTSL 213.25□□□□□ -0.291e-30■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SERPINF1-210ENST00000573770 789 ntTSL 313.23□□□□□ -0.298e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PRKCB-205ENST00000472066 556 ntTSL 313.22□□□□□ -0.297e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF330-203ENST00000506302 1180 ntTSL 213.21□□□□□ -0.297e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP2-211ENST00000528599 1663 ntTSL 1 (best)13.09□□□□□ -0.317e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TDRD3-201ENST00000196169 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.317e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PRIMPOL-209ENST00000512834 2174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.317e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF683-202ENST00000403843 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.327e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-252ENST00000637832 701 ntTSL 513.04□□□□□ -0.327e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-204ENST00000574822 806 ntTSL 513.04□□□□□ -0.327e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP2-202ENST00000359831 2264 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.327e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ANO10-207ENST00000428472 592 ntTSL 412.96□□□□□ -0.337e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.347e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SLC16A1-AS1-207ENST00000627431 1073 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.358e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMUG1-224ENST00000635234 484 ntTSL 512.88□□□□□ -0.357e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IRF9-211ENST00000560852 731 ntTSL 312.86□□□□□ -0.357e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP2-212ENST00000532708 1956 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.357e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 KLF11-206ENST00000540845 3885 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.367e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PHACTR1-206ENST00000406205 792 ntTSL 512.78□□□□□ -0.367e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CACNA1A-250ENST00000637809 871 ntTSL 512.78□□□□□ -0.367e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 POU6F2-206ENST00000517348 1578 ntTSL 212.71□□□□□ -0.377e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 LEF1-221ENST00000515500 1037 ntTSL 212.7□□□□□ -0.387e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RETREG2-208ENST00000458520 992 ntTSL 312.68□□□□□ -0.387e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TNXB-202ENST00000442721 372 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.47e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF418-206ENST00000598213 496 ntTSL 312.55□□□□□ -0.47e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP2-AS1-202ENST00000438298 1106 ntTSL 212.54□□□□□ -0.41e-30■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IRF9-205ENST00000559284 583 ntTSL 512.5□□□□□ -0.417e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ACSBG2-202ENST00000586696 2739 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.417e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PSMB3-211ENST00000619426 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.417e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IRF9-213ENST00000561342 1066 ntTSL 512.46□□□□□ -0.417e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.427e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DUS2-215ENST00000575677 570 ntTSL 312.42□□□□□ -0.427e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.437e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TNFAIP2-210ENST00000561156 590 ntTSL 412.37□□□□□ -0.437e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TRAF3IP2-207ENST00000368761 5128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.437e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 AP3S2-202ENST00000423566 1262 ntTSL 212.33□□□□□ -0.447e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IRF9-212ENST00000561009 546 ntTSL 212.32□□□□□ -0.447e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IRF9-209ENST00000560365 623 ntTSL 212.32□□□□□ -0.447e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PIGS-209ENST00000577620 608 ntTSL 412.27□□□□□ -0.457e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PIGS-204ENST00000465444 578 ntTSL 512.27□□□□□ -0.457e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 GSTCD-203ENST00000394730 4043 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.457e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 DUS2-205ENST00000564781 540 ntTSL 512.2□□□□□ -0.467e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 VILL-203ENST00000412008 813 ntTSL 312.18□□□□□ -0.467e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ACSBG2-210ENST00000591403 2690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.467e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 RRP12-211ENST00000536831 4476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.468e-21■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TFCP2L1-201ENST00000263707 9292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.477e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 TCHP-210ENST00000551627 581 ntTSL 212.14□□□□□ -0.477e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 IRF9-207ENST00000560275 841 ntTSL 512.11□□□□□ -0.477e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 CORO2A-202ENST00000375077 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.487e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 ZNF330-201ENST00000262990 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.487e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 SMAD7-205ENST00000587336 549 ntTSL 412.04□□□□□ -0.487e-11■■■■■ 260.8
UTP3Q9NQZ2 PPIG-208ENST00000462903 1516 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.487e-11■■■■■ 260.8
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