Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLSTN2Q9H4D0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLSTN2Q9H4D0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms