Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM7Q9C029 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM7Q9C029 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms