Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GAL3ST1Q99999 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GAL3ST1Q99999 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms