Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VGLL1Q99990 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms