Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHP1Q99653 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms