Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PPP1R9BQ96SB3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PPP1R9BQ96SB3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms