Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CITED4Q96RK1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CITED4Q96RK1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms