Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TSNARE1Q96NA8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TSNARE1Q96NA8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms