Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C9orf85Q96MD7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C9orf85Q96MD7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms