Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
LINC00208Q96KT6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
LINC00208Q96KT6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms