Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PHACTR3Q96KR7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PHACTR3Q96KR7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms