Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL53Q96EL3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms