Protein–RNA interactions for Protein: Q96C10

DHX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX58Q96C10 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DHX58Q96C10 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DHX58Q96C10 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms