Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UTP4Q969X6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UTP4Q969X6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms