Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BRSK1Q8TDC3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BRSK1Q8TDC3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms