Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEY3

SPATA4, Spermatogenesis-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA4Q8NEY3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPATA4Q8NEY3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA4Q8NEY3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms