Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CSGALNACT2Q8N6G5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CSGALNACT2Q8N6G5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms