Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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USP34Q70CQ2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
USP34Q70CQ2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
USP34Q70CQ2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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