Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GBP6Q6ZN66 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GBP6Q6ZN66 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms