Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC137Q6PK04 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC137Q6PK04 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms