Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NEPROQ6NW34 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NEPROQ6NW34 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms