Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
GKAP1Q5VSY0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GKAP1Q5VSY0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms