Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MARCH8Q5T0T0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH8Q5T0T0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH8Q5T0T0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms