Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NHSL1Q5SYE7 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NHSL1Q5SYE7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NHSL1Q5SYE7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms