Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RTL8BQ17RB0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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