Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
IMPG1Q17R60 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
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