Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTN1Q16799 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RTN1Q16799 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RTN1Q16799 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
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