Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX1AQ16623 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX1AQ16623 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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