Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
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FXNQ16595 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
FXNQ16595 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
FXNQ16595 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
FXNQ16595 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FXNQ16595 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FXNQ16595 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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FXNQ16595 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FXNQ16595 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FXNQ16595 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FXNQ16595 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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