Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LAMA4Q16363 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LAMA4Q16363 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms