Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LAPTM4AQ15012 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAPTM4AQ15012 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms