Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SSPNQ14714 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SSPNQ14714 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms