Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PKP1Q13835 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PKP1Q13835 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms