Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRJQ12913 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRJQ12913 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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