Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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RAB40BQ12829 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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RAB40BQ12829 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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RAB40BQ12829 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB40BQ12829 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RAB40BQ12829 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RAB40BQ12829 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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RAB40BQ12829 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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RAB40BQ12829 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB40BQ12829 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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