Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
RIPPLY1Q0D2K3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms