Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTN3Q08043 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTN3Q08043 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms