Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RUNX1T1Q06455 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RUNX1T1Q06455 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms