Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTK2Q05397 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTK2Q05397 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms