Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SPTBN1Q01082 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SPTBN1Q01082 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms